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cancerdata

  • 更新日期:2025-05-17 21:31:39
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详细介绍:

CancerData.org 完整介绍及图文攻略指南

CancerData.org

癌症研究数据共享平台完整指南

全面介绍全球领先的癌症研究数据共享平台的功能特点、使用方法和学术应用攻略

平台概述

CancerData.org是由荷兰马斯特里赫特大学Maastro诊所医学信息学与知识工程团队(MIKE)开发的专业癌症研究数据共享平台

核心使命

  • 提供可持续的临床协议、发表文献和研究数据集的中央在线存储库
  • 促进癌症治疗和研究领域的协作努力
  • 推进计算机辅助治疗诊断学(CAT)概念的发展
  • 为癌症研究提供标准化的数据收集和分析框架

平台特色

持久标识符:DataCite注册成员,提供DOI标识符
开源驱动:完全基于自由开源软件构建
国际协作:与欧洲粒子治疗网络(EPTN)合作
数据安全:匿名化处理,保护患者隐私

发展背景与技术基础

学术背景

  • • 荷兰马斯特里赫特大学Maastro诊所
  • • MIKE医学信息学团队
  • • 国际癌症研究协作网络
  • • 欧洲粒子治疗网络合作伙伴

专业领域

  • • 神经肿瘤学研究
  • • 脑肿瘤放射治疗
  • • 粒子治疗毒性评估
  • • 器官风险评估标准

技术架构

  • • 自由开源软件(FOSS)
  • • DataCite DOI系统
  • • DICOM/AIM格式支持
  • • 云端数据存储

核心功能特性

医学影像数据库

支持格式

DICOM格式:标准医学影像格式
AIM格式:医学影像标注格式
3D影像:三维医学影像数据

影像类型

CT扫描
MRI影像
PET扫描
X射线
超声影像
病理影像

脑肿瘤研究专业资源

EPTN神经学图谱

  • • 国际神经肿瘤学轮廓图谱
  • • 25个共识器官风险评估
  • • CT和MRI多模态显示
  • • 横断面、矢状面、冠状面视图

毒性评分标准

  • • 脑肿瘤放射治疗后毒性评估
  • • 光子和粒子治疗对比
  • • 统一毒性数据收集框架
  • • 成人脑肿瘤随访标准

耐受剂量指南

  • • 脑部器官风险耐受剂量
  • • 分次剂量共识指南
  • • EQD2值计算标准
  • • 线性二次公式应用

DOI持久标识符系统

系统优势

全球唯一识别:每个数据集都有唯一的DOI标识符,确保全球范围内的唯一识别和引用
持久性链接:DOI链接永不失效,确保研究数据的长期可访问性
便捷引用:简化了学术引用过程,促进数据的重复使用和协作研究

DOI示例

EPTN神经学图谱:
doi:10.17195/candat.2021.02.1
毒性评分标准:
doi:10.17195/candat.2021.09.1
耐受剂量指南:
doi:10.17195/candat.2018.01.1

主要数据集与资源

EPTN国际神经学轮廓图谱

图谱内容

• 脑部结构
• 脑干(中脑、脑桥、延髓)
• 视交叉
• 小脑(前后部)
• 耳蜗
• 角膜
• 海马体(前后部)
• 下丘脑
• 晶状体
• 泪腺
• 视神经
• 垂体
• 皮肤
• 前庭和半规管
• 杏仁核
• 尾状核
• 胼胝体
• 穹窿
• 黄斑
• 视束
• 眶额皮质
• 脑室周围间隙
• 松果体
• 丘脑

技术规格

CT影像:WW/WL 120/40, 3000/600
3T MRI:T1Gd, T2FLAIR 1mm
7T MRI:MP2RAGE 0.7mm
多平面显示:横断面、矢状面、冠状面

脑肿瘤毒性评估数据

评估标准

  • • 共识性毒性评分框架
  • • 多中心数据收集标准
  • • 随访时间点规范
  • • 毒性分级系统

治疗类型

  • • 光子放射治疗
  • • 粒子束治疗
  • • 质子治疗
  • • 重离子治疗

评估内容

  • • 急性毒性反应
  • • 晚期毒性效应
  • • 认知功能影响
  • • 神经系统并发症

深度学习模型与工具

脑室分割模型

nnU-Net模型:自动分割脑室和脑室周围间隙
技术支持:CT和T1CE MRI影像分析
应用场景:神经肿瘤患者治疗计划优化
代码开源:GitLab代码库公开可用

性能优势

相比传统方法,分割精度显著提升
放射治疗技师认可度更高
改善脑癌患者器官风险轮廓过程
支持颅内放射治疗计划优化

使用教程与操作指南

快速入门指南

1

访问平台

打开CancerData.org官方网站,浏览平台介绍和功能概述

2

注册账户

创建CancerData账户以访问私有数据集和高级功能

3

浏览数据

探索可用的数据集、医学影像和研究资源

4

下载使用

下载所需数据并在研究中引用DOI标识符

数据访问与下载

访问类型

公开数据:无需账户即可浏览和下载的匿名化数据
私有数据:需要账户登录才能访问的受限数据集
协作数据:研究团队共享的项目特定数据

下载步骤

  1. 1 选择所需的数据集或影像集合
  2. 2 检查数据使用许可和引用要求
  3. 3 登录账户(如果需要)
  4. 4 点击下载按钮获取数据文件
  5. 5 在研究中正确引用DOI标识符

数据格式与工具

DICOM格式

  • • 医学数字成像通信标准
  • • 包含影像数据和元数据
  • • 支持多种医学影像设备
  • • 标准化的文件格式
推荐工具:ImageJ, OsiriX, 3D Slicer

AIM格式

  • • 标注和影像标记格式
  • • 包含ROI区域定义
  • • 支持复杂几何形状
  • • 语义标注信息
推荐工具:ePAD, ClearCanvas, OHIF Viewer

其他格式

  • • CSV数据表格
  • • PDF文档资料
  • • XML结构化数据
  • • 压缩包文件
推荐工具:Excel, R, Python pandas

研究应用与学术价值

主要研究领域

神经肿瘤学研究

脑肿瘤分析:多种脑肿瘤类型的影像学特征研究和预后分析
放射治疗优化:剂量分布优化和器官风险最小化策略研究
粒子治疗:质子和重离子治疗的疗效和安全性评估

计算机辅助诊疗

AI模型开发:深度学习在医学影像分析中的应用和验证
预测模型:治疗结果预测和个体化治疗方案优化
大数据分析:多中心数据整合和群体特征分析

学术影响与合作

国际协作

与欧洲粒子治疗网络(EPTN)等国际组织密切合作,推动全球癌症研究标准化

学术发表

支持多项高质量学术论文发表,为癌症研究领域提供重要数据支撑

创新驱动

促进医学AI、精准医疗和个体化治疗等前沿技术的研发和应用

引用规范与学术诚信

标准引用格式

基本格式:

作者姓名. 数据集标题. CancerData, 年份; doi:DOI标识符

示例:

Eekers D, Di Perri D, Roelofs E, Postma A, Troost EG.
EPTN International Neurological Contouring Atlas - 2021 Update.
CancerData, 2021; doi:10.17195/candat.2021.02.1

使用须知

必须引用:使用平台数据必须在论文中正确引用DOI标识符
数据保护:严格遵守患者隐私保护和数据使用协议
成果共享:鼓励将研究成果回馈给科研社区
合作精神:促进开放科学和国际协作

常见问题解答

如何获取CancerData账户?

访问CancerData.org官网,点击注册链接创建账户。公开数据可以自由浏览和下载,私有数据集需要账户登录。如果需要访问特定的研究项目数据,可能需要额外的权限申请。

如何下载和使用医学影像数据?

平台提供DICOM格式的医学影像和AIM格式的标注数据。选择所需数据集后,点击下载按钮即可获取。建议使用专业的医学影像软件如ImageJ、3D Slicer或OsiriX来查看和分析数据。

数据隐私和安全如何保障?

所有患者数据都经过严格的匿名化处理,移除了所有可识别个人身份的信息。平台遵循国际医学数据保护标准,确保数据使用的合法性和伦理性。用户在使用数据时需要遵守相关的使用协议。

如何正确引用平台数据?

每个数据集都有唯一的DOI标识符,在学术论文中使用数据时必须正确引用。引用格式为:作者姓名. 数据集标题. CancerData, 年份; doi:DOI标识符。具体的引用格式在每个数据集页面都有详细说明。

推荐使用哪些软件工具?

对于DICOM影像:推荐使用ImageJ(免费)、3D Slicer(开源)、OsiriX(Mac)或RadiAnt DICOM Viewer。对于AIM标注:推荐ePAD、ClearCanvas或OHIF Viewer。对于数据分析:推荐使用R、Python或MATLAB进行统计分析和机器学习。

如何参与数据贡献和协作?

研究机构和个人研究者可以通过联系表单申请贡献数据。平台欢迎高质量的癌症研究数据,特别是神经肿瘤学相关的影像和临床数据。所有贡献的数据都会经过质量审核和标准化处理。

CancerData.org

推动癌症研究的数据共享与协作

开发机构

荷兰马斯特里赫特大学
Maastro诊所
MIKE医学信息学团队

重要链接

  • • 官方网站:cancerdata.org
  • • DataCite成员
  • • 欧洲粒子治疗网络合作
  • • 开源软件基础

使用群体

  • • 癌症研究人员
  • • 放射肿瘤学专家
  • • 医学影像学者
  • • 临床医师

本指南旨在帮助研究人员更好地理解和使用CancerData.org平台资源,推动癌症研究的进步与发展

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