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NITRC(神经影像工具)

  • 更新日期:2025-06-02 22:29:23
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详细介绍:

NITRC

NeuroImaging Tools and Resources Collaboratory

神经影像工具与资源协作平台 - 全球最大的神经影像分析工具和数据资源集散地

72,645+ 注册用户
1,350+ 工具资源
NIH资助项目

平台概述

什么是NITRC?

NITRC(神经影像工具与资源协作平台)是由美国国立卫生研究院(NIH)生物医学影像与生物工程研究所(NIBIB)资助的综合性平台,致力于为神经影像研究社区提供工具、资源、数据和计算环境。

开源神经影像分析软件集散地
大规模神经影像数据资源库
云计算环境和虚拟机服务
研究社区协作交流平台
NITRC主页界面

全球覆盖

服务全球神经影像研究社区,支持多语言和跨平台使用

开放共享

倡导开源精神,促进科研工具和数据的自由分享

前沿技术

汇聚最新的神经影像分析技术和人工智能算法

核心功能模块

SOFTWARE

神经影像分析软件

FreeSurfer
FSL
SPM

DATA

神经影像数据集

NITRC-IR
公开数据集
去标识化数据

DIAGNOSIS

诊断辅助工具

疾病分类
影像标注
AI诊断

EDUCATION

教育培训资源

在线教程
培训课程
研讨会

特色工具推荐

BabelBrain

专为经颅超声刺激(TUS)神经调制研究设计的开源独立图形用户界面应用程序。支持多GPU后端,兼容Linux、macOS和Windows系统。

计算脑组织中的传输声场
支持MRI、CT和零回波时间MRI扫描
热效应计算和可视化

DeepISLES

先进的缺血性脑卒中病灶MRI分割工具。准确识别和分割各种大小、缺血计数和模式的脑梗死,基于ISLES 2022挑战赛开发。

支持DWI、ADC和FLAIR图像
多种病灶大小和模式适配
高精度自动分割

FreeSurfer

用于重建大脑皮质表面的自动化工具套件,从结构MRI数据重建大脑皮质表面,并将功能MRI数据覆盖到重建的表面上。

皮质表面重建
功能数据映射
全球广泛使用

BrainNet Viewer

北京师范大学开发的脑网络可视化Matlab工具包,帮助研究人员快速、简单、灵活地从不同层次可视化人类大脑连接组。

脑网络可视化
多层次展示
Matlab环境

工具检索与发现

 

关键词搜索

使用工具名称、功能描述或技术标签快速定位所需软件

fMRI
structural
segmentation
 

分类筛选

按照域、平台、开发状态等多维度筛选合适的工具

Windows
Linux
macOS
 

推荐排序

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搜索使用技巧

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选择稳定版本或最新开发版本

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NITRC-IR 数据仓库

NITRC Image Repository (NITRC-IR)

NITRC-IR是一个公开分发去标识化社区生成数据集的平台,包含数千个MR、fMRI、DTI、PET和CT图像,以及相关的临床和基因组数据。

大规模神经影像数据集
完全去标识化处理
免费下载使用

数据类型统计

结构MRI
 
85%
功能MRI
 
72%
DTI
 
58%
PET
 
35%

数据下载流程

1
注册账户

免费注册NITRC账户

2
浏览数据

搜索所需数据集

3
申请权限

提交数据使用申请

4
下载数据

获得权限后下载

NITRC-CE 计算环境

云端计算环境

NITRC-CE(Computational Environment)提供预配置的虚拟机和云计算资源,让研究人员无需本地安装即可使用各种神经影像分析工具。

NITRC-CE LITE

轻量级虚拟机,预装常用工具

NITRC-CE PRO

专业版本,高性能计算资源

定制环境

根据研究需求定制虚拟机

预装软件包

FreeSurfer
FSL
SPM
AFNI
ANTs
3D Slicer
ITK-SNAP
MRIcron
50+ 其他工具
快速启动

5分钟内启动完整分析环境

自动同步

工具和数据自动更新

弹性扩展

按需扩展计算资源

社区协作功能

论坛交流

活跃的社区论坛为用户提供技术交流、问题解答和经验分享的平台。

功能连接分析 49 posts

最新帖子:May 29

CONN工具箱 1007 posts

最新帖子:May 29

网络统计分析 1350 posts

最新帖子:May 29

活动日历

定期举办的研讨会、培训班和学术会议,促进学术交流与合作。

SPARC FAIR Codeathon

Jun 1 - Pitch Phase

Analysis and Modeling

Jun 4 - Connectomes

Gastroenterology Conference

Jun 4 - Scotland

最新资讯与更新

Latest News

NeuroMDOT Newsletter May 27
NITRC 21.72 released May 20
MCALT 1.5 Template Apr 30

Updated Files

GitLab Releases: FBN125 May 30
NAA-CH2 Editing May 27
NeuroRDOT Newsletter May 23

Registered Tools

Network Level Analysis May 14
Brain AnalyzIR Toolbox Feb 24
F6IIs Template Feb 24

教程资源与学习指南

视频教程

  • NITRC-IR使用指南
  • 计算环境快速上手
  • 工具检索技巧
  • 专家讨论面板
总时长: 2+ 小时

文档资料

  • NITRC用户手册
  • API开发指南
  • 数据格式规范
  • 最佳实践案例
可下载PDF

在线研讨会

  • 每月技术分享
  • 新工具发布会
  • 用户案例分析
  • Q&A答疑会
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最佳实践与使用技巧

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安装前详细阅读工具说明和系统要求

参与社区讨论

积极参与论坛交流,分享使用经验

数据备份

下载重要数据后及时进行本地备份

注意事项

许可证合规

确保遵守工具和数据的使用许可协议

系统兼容性

检查操作系统和硬件兼容性要求

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记录使用的工具版本,确保结果可重现

专家建议

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通过NITRC认识更多同领域研究者

收藏常用工具

建立个人工具库,提高工作效率

贡献社区资源

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www.nitrc.org
support@nitrc.org
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本指南基于NITRC官方资源整理,内容持续更新
NITRC使用指南

本文档旨在帮助研究人员更好地利用NITRC平台资源进行神经影像研究

资助信息:NIH Grant number: 5R24EB029173

版本:v2.1.72-0 | 最后更新:2024年6月

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