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数据宝库

TCIA癌症影像档案馆

  • 更新日期:2025-06-02 20:31:59
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详细介绍:

TCIA

The Cancer Imaging Archive

癌症影像档案库完整介绍与使用攻略

全球最大的开放获取癌症医学影像数据库使用指南

TCIA数据库概述

什么是TCIA?

The Cancer Imaging Archive (TCIA) 是由美国国家癌症研究所(NCI)癌症影像计划资助的开放获取医学影像数据库。该数据库去标识化并托管大量癌症医学影像,供公众免费下载使用。

核心使命

  • • 提供高质量的癌症医学影像数据
  • • 促进癌症研究和影像生物标志物发现
  • • 支持人工智能和机器学习研究
  • • 推动精准医学发展
TCIA首页界面

TCIA数据库首页界面

数据库统计信息

100+
数据集合
50,000+
患者数据
10M+
影像文件
500TB+
数据总量

核心功能特点

 

开放获取

完全免费的公共数据库,支持全球研究人员无限制访问和下载

 

数据去标识化

所有患者信息均已去标识化处理,确保隐私保护的同时保持数据完整性

 

多模态影像

支持CT、MRI、PET、病理切片等多种医学影像模态

 

DICOM标准

主要采用DICOM格式存储影像数据,确保标准化和互操作性

 

临床数据整合

提供患者预后、治疗细节、基因组学等相关临床信息

 

API接口

提供REST API接口,支持程序化访问和批量数据处理

数据类型与格式

影像模态类型

计算机断层扫描 (CT)

胸部、腹部、全身CT扫描,包括增强和非增强

磁共振成像 (MRI)

T1、T2、FLAIR、DWI等多种序列的MRI影像

正电子发射断层扫描 (PET)

FDG-PET及其他示踪剂的功能性影像

数字病理学

组织切片的高分辨率数字化图像

癌症类型覆盖

  • • 肺癌 (Lung Cancer)
  • • 乳腺癌 (Breast Cancer)
  • • 脑癌 (Brain Cancer)
  • • 前列腺癌 (Prostate Cancer)
  • • 肝癌 (Liver Cancer)
  • • 结直肠癌 (Colorectal Cancer)
  • • 胰腺癌 (Pancreatic Cancer)
  • • 肾癌 (Kidney Cancer)
  • • 皮肤癌 (Skin Cancer)
  • • 其他罕见癌症

文件格式

DICOM (.dcm) 主要影像格式
NIfTI (.nii) 神经影像格式
SVS (.svs) 病理切片格式
CSV/XML 临床数据格式

注册与访问

重要提醒

TCIA数据库完全开放,无需注册即可浏览和下载大部分数据。但建议注册账户以获得更好的使用体验。

访问方式

1

直接访问

访问 www.cancerimagingarchive.net

2

浏览数据集

点击"Browse Collections"查看所有可用数据集

3

搜索数据

使用"Access The Data"进入高级搜索界面

注册优势

  • 创建和保存个人数据集收藏
  • 接收数据库更新通知
  • 使用高级搜索和过滤功能
  • 批量数据下载和管理

注册步骤

  1. 1. 点击页面右上角"Login/Register"
  2. 2. 选择"Create New Account"
  3. 3. 填写基本信息(邮箱、机构等)
  4. 4. 验证邮箱激活账户

数据下载工具与方法

NBIA Data Retriever

NBIA Data Retriever界面

主要特点

  • • 官方推荐的下载工具
  • • 支持批量下载DICOM数据
  • • 自动验证数据完整性
  • • 断点续传功能
  • • 跨平台支持 (Windows/Mac/Linux)

安装和使用步骤

1

下载安装程序

从TCIA官网下载适用于您操作系统的NBIA Data Retriever

2

安装Java环境

确保系统已安装Java 8或更高版本

3

生成下载清单

在TCIA搜索页面选择数据后,点击"Download"生成.tcia文件

4

开始下载

用NBIA Data Retriever打开.tcia文件,选择下载目录并开始

其他下载方式

网页直接下载

适用于小量数据,直接在浏览器中下载单个系列

REST API

程序化访问,适合批量数据处理和自动化工作流

云端访问

通过Google Cloud Platform等云服务直接访问

下载注意事项

  • • 大型数据集下载可能需要数小时甚至数天
  • • 确保有足够的存储空间(某些数据集超过100GB)
  • • 使用稳定的网络连接,避免下载中断
  • • 定期备份下载的数据,避免意外丢失
  • • 遵守数据使用协议和引用要求

视频教程资源

TCIA基础介绍

TCIA数据库的基本功能和使用方法介绍

时长: 6:30 940 views

数据搜索技巧

如何高效地在TCIA中搜索和筛选所需数据

时长: 2:54 1,253 views

Data Retriever使用

NBIA Data Retriever工具的详细使用教程

时长: 2:42 40,187 views

数据共享和导出

如何在TCIA中共享和导出数据集

时长: 2:27 1,008 views

Mimics数据获取

如何从TCIA获取数据用于Mimics软件分析

时长: 9:30 129 views

OCCPR Webinar

TCIA官方网络研讨会,深入介绍平台功能

时长: 48:03 757 views

学习路径建议

初学者路径

  1. 1. 观看"TCIA基础介绍"了解平台概况
  2. 2. 学习"数据搜索技巧"掌握检索方法
  3. 3. 实践"Data Retriever使用"完成首次下载
  4. 4. 尝试小规模数据集进行分析

进阶用户路径

  1. 1. 参加"OCCPR Webinar"了解高级功能
  2. 2. 学习API使用进行程序化访问
  3. 3. 结合分析软件进行数据处理
  4. 4. 参与社区讨论和最佳实践分享

实用技巧与常见问题

实用技巧

提高下载效率

  • • 使用有线网络连接代替WiFi
  • • 在网络使用低峰期进行大量下载
  • • 分批下载大型数据集
  • • 配置NBIA Data Retriever的并发设置

数据管理建议

  • • 建立清晰的文件夹结构
  • • 保留原始DICOM元数据
  • • 定期备份重要数据集
  • • 记录数据来源和处理历史

高效搜索策略

  • • 使用多个搜索条件组合
  • • 查看数据集的详细描述
  • • 关注数据质量评级
  • • 优先选择有配套注释的数据

常见问题解答

Q: 下载速度很慢怎么办?

A: 尝试更换下载时间,使用有线网络,或联系IT部门检查防火墙设置。大型数据集建议分批下载。

Q: DICOM文件无法打开?

A: 确保使用支持DICOM格式的软件,如3D Slicer、ImageJ、或专业医学影像查看器。检查文件是否完整下载。

Q: 如何引用TCIA数据?

A: 每个数据集都有特定的引用格式,在数据集页面的"Citations & Data Usage Policy"部分可以找到详细要求。

Q: 能否用于商业用途?

A: 大部分数据集允许学术和商业使用,但需要查看具体的数据使用协议。某些数据集可能有特殊限制。

Q: 如何获得技术支持?

A: 通过TCIA官网的Help页面提交问题,或发送邮件至官方支持团队。社区论坛也是获得帮助的好地方。

数据使用最佳实践

伦理考虑

  • • 尊重数据提供者的研究成果
  • • 遵循数据使用协议条款
  • • 不尝试重新识别患者身份
  • • 合理共享研究发现

技术建议

  • • 验证数据质量和完整性
  • • 记录所有数据处理步骤
  • • 使用版本控制管理分析代码
  • • 发布研究时提供数据集链接

高级功能与API使用

REST API接口

API基础信息

// API基础URL
https://services.cancerimagingarchive.net/services/v4/TCIA/query
 
// 获取所有Collection
GET /getCollectionValues
 
// 获取患者信息
GET /getPatient?Collection={collection}

Python示例

使用requests库访问TCIA API获取数据清单

批量处理

编写脚本自动化下载和预处理大型数据集

数据验证

程序化验证下载数据的完整性和一致性

集成开发环境

Python生态系统

  • • PyDICOM:DICOM文件处理
  • • SimpleITK:医学图像分析
  • • Pandas:临床数据处理
  • • Scikit-learn:机器学习分析

R语言工具

  • • oro.dicom:DICOM读取包
  • • radiomics:影像组学特征提取
  • • ggplot2:数据可视化
  • • caret:预测建模

专业软件集成

  • • 3D Slicer:医学图像可视化
  • • MATLAB:图像处理工具箱
  • • ImageJ/Fiji:开源图像分析
  • • ITK-SNAP:图像分割工具

相关资源与链接

引用格式

推荐引用格式:

"Data used in this publication were obtained from The Cancer Imaging Archive (TCIA) sponsored by the CANCER IMAGING PROGRAM, DCTD/NCI/NIH. DOI: [specific dataset DOI]"

TCIA - The Cancer Imaging Archive

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本指南旨在帮助研究人员更好地利用TCIA数据库资源

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